翔安区属南亚热带海洋性季风气候区，境内河流短促，水系呈树枝状。土壤以红壤为主，占26.6%，水稻土为主要耕作土，占19.8%，据1989年资源调查统计资料，全区已利用于农林牧产业生产的各类土地面积共13923.15公顷，占土地总面积的39.6%。

　　翔安植物资源丰富，各类主要植物共190科732属1306种。主要优良树种有属用材树种的杉木、马尾松、柳杉、栲树、木荷、桉树、麻楝、银桦、相思树等；经济树种：油茶、油桐、板栗、乌桕等。此外还有5种纤维类、10种油科类、7种淀粉类的野生植物。境内水果种类50多个，其中亚热带水果有龙眼、荔枝、柑桔、枇杷、杨桃、柚等；热带水果柚菠萝、香蕉、番木瓜、西番莲、波罗蜜等；温带水果有桃、李、柿、葡萄、板栗等；还有余甘、枳壳、杨梅、草莓、石榴、桃金娘等野生半野生果树。其中龙眼为大宗果树。种植药材主要品种有姜黄、泽舍、一见喜、白菊花、生地、玫瑰茄、川芎、紫苏、排草、肉桂、枳壳）水枝子等。1988年种植药材333亩，总产53.1吨；1991年207亩，总产34吨；2003年40亩，总产值7万元；2007年130亩，总产量16.9吨。野生的药材主要有灵芝、蛇舌草、砂仁、薄荷、茯苓、金线莲、天门冬等。

　　翔安山海俱备，水陆面积开阔，气候环境适宜，动物资源丰富。翔安海区水生动物种类繁多。据调查，海区浮游动物有原生动物门、肛肠动物门、毛腭动物门、节肢动物门、软体动物门、被囊动物门379种，虾蟹类76种，贝类77种，海水鱼类420种，其中文昌鱼、真鲷、马鲛、鲳、石斑鱼、对虾、三疣梭子蟹、无针乌贼、海蜇、海豚等经济价值较高。可供养殖的有贝类4种、海水鱼类4种、虾蟹类3种。淡水鱼类常见的有12科28种，其中鲤科类14种。人工养殖的有鲫鱼，自然增殖的有青虾、毛蟹、河蚌等。

　　境内矿产资源丰富，特别是高岭土、花岗岩、砂石分布广，面积大，品味高，储量丰富，具有较大的经济开采价值。其原材料加工产品销往日本、港、澳和东南亚地区。